Après les antibiotiques, le régime méditerranéen aide le microbiome intestinal

Ce que nous mangeons peut également faire une différence dans la capacité de récupération de notre microbiote intestinal après une cure d’antibiotiques. C'est ce que suggère une nouvelle étude publiée dans Nature, selon laquelle un régime méditerranéen favoriserait la restauration naturelle et rapide des bactéries intestinales utiles. Les études ont été menées sur des souris, mais elles contribuent à élargir les connaissances sur l’alimentation et le microbiote intestinal.

Régimes alimentaires et microbiote

Bien que l’enthousiasme pour les tests du microbiote soit aujourd’hui exagéré, plusieurs études soulignent l’importance que cette grande quantité et cette variété de bactéries (en particulier, mais pas seulement) ont sur notre santé. Tout comme il existe de nombreuses recherches sur les régimes alimentaires et le microbiote. Par exemple, les aliments ultra-transformés et une alimentation très riche en graisses et pauvre en fibres en général semblent avoir un impact négatif sur la diversité bactérienne et augmentent le risque de développer certaines maladies métaboliques, rappellent les auteurs. Au contraire, un régime de type méditerranéen semble avoir, parmi ses nombreux bienfaits, un impact positif sur la composition de notre microbiote. Surtout, comme le montrent les recherches actuelles, après la prise d’antibiotiques, qui attaquent non seulement les bactéries pathogènes mais aussi les « bonnes » bactéries de notre système digestif.

Méditerranée et « Occident » en comparaison

Les auteurs de la nouvelle étude ont nourri un groupe de souris avec un régime plus ou moins similaire au régime méditerranéen, c'est-à-dire riche en fibres végétales et pauvre en graisses, tandis qu'ils ont nourri un deuxième groupe avec ce qu'ils appellent un « régime occidental », c'est-à-dire un régime malsain, riche en graisses et pauvre en fibres. Ils ont ensuite observé dans quelle mesure leur microbiote se rétablissait après la prise d’antibiotiques.

Au cours de l’étude, les chercheurs ont également testé les effets de la transplantation fécale, qui vise à favoriser la restauration du microbiote en transférant des bactéries intestinales d’un individu sain à un individu dont la flore bactérienne est endommagée (en pratique clinique, elle est aujourd’hui principalement utilisée pour le traitement des infections à Clostridium difficile ).

C'est ainsi que renaît la flore bactérienne

En analysant la composition du microbiote intestinal de souris soumises à deux régimes différents et à une transplantation fécale, le groupe de recherche a observé que seules celles qui avaient reçu un régime de type méditerranéen ont connu une restauration régulière de la flore intestinale après la prise d'antibiotiques. « Ce n’est pas parce que le régime alimentaire occidental ne fournit pas les bons nutriments aux bons microbes au bon moment »,explique Eugene Chang de l’Université de Chicago, qui a coordonné la recherche. « On se retrouve avec quelques espèces qui monopolisent ces ressources et ne créent pas les conditions nécessaires au rétablissement d’autres organismes. »

Doutes sur la transplantation fécale

Les autres animaux, cependant, se sont révélés plus sensibles à l’infection par la bactérie Salmonella, et même la transplantation fécale ne semble pas être efficace pour rétablir la quantité et la variété adéquates de bactéries intestinales. « Nos données remettent en question l’enthousiasme généralisé pour la transplantation de microbiote fécal (FMT) comme stratégie pour lutter contre la dysbiose et démontrent que des interventions diététiques spécifiques sont, au minimum, une condition préalable essentielle à une transplantation fécale efficace et peuvent représenter une alternative plus sûre, plus naturelle et moins invasive », concluent les auteurs.