CNIO разрабатывает геномный тест для прогнозирования эффективности химиотерапии

Число диагностированных в Испании в 2025 году случаев рака достигнет 296 103, что представляет собой небольшое увеличение на 3,3% по сравнению с 2024 годом, когда было зарегистрировано 286 664 случая, согласно данным Испанского общества медицинской онкологии (SEOM). Химиотерапия, направленная на уничтожение опухолевых клеток с помощью лекарств, была стандартным методом лечения рака в течение десятилетий. Однако она не всегда успешна.

Новое исследование под руководством Джеффа Макинтайра , руководителя Computational Oncology Group в Испанском национальном центре исследований рака (CNIO), было опубликовано в этот понедельник в журнале Nature Genetics. Это исследование раскрывает биомаркеры, которые предсказывают , какие пациенты не будут реагировать на обычно используемые химиотерапии на основе соединений, содержащих платину, таксанов и антрациклинов. Работа была проведена в сотрудничестве с Кембриджским университетом и спин-офф компанией Tailor Bio. В качестве первых авторов также выступают Джо Снит Томпсон и Барбара Эрнандо из CNIO, а также Лаура Мадрид из Tailor Bio.

«Химиотерапия полезна для некоторых пациентов, но она эффективна не во всех случаях. От 20% до 50% онкологических больных не реагируют на эти препараты. Эти пациенты будут страдать от побочных эффектов, вызванных химиотерапией, без какой-либо клинической пользы», — объясняет Макинтайр.

«Важно, что наше исследование вводит биомаркеры, которые позволяют проводить стратификацию пациентов при использовании нескольких химиотерапий, изначально не разработанных как таргетные терапии », — говорится в исследовании. «Мы разработали геномный тест, который позволяет использовать три стандартные химиотерапии таргетным образом, то есть у пациентов, которые знают, что они отреагируют на них», — объясняет Томпсон. «Этот тест можно применять к разным типам рака; наши результаты могут принести пользу сотням тысяч пациентов каждый год».

Распознайте каждую опухоль

Метод, разработанный командой CNIO, основан на том факте, что многие опухоли накапливают изменения или изменения в числе хромосом своих клеток. Одним из последствий, объясняет Лаура Мадрид , является то, что «раковые клетки не имеют соответствующего количества генетического материала».

Эти изменения варьируются от опухоли к опухоли , так что вместе они образуют характерный рисунок, сигнатуру хромосомной нестабильности . Опубликованное исследование разрабатывает биомаркеры на основе этих сигнатур хромосомной нестабильности.

Эти биомаркеры позволяют « рано выявлять пациентов, устойчивых к этим методам лечения, чтобы можно было выбрать альтернативные, более эффективные методы лечения, избегая тем самым ненужных побочных эффектов», — объясняет Макинтайр.

Точное использование химиотерапии приносит пользу не только пациентам, но и системе в целом: за счет снижения стоимости неэффективных методов лечения и лечения осложнений, связанных с побочными эффектами терапии, снижаются расходы на здравоохранение .

Данные более 800 пациентов

После разработки биомаркеров команда CNIO протестировала их инновационным способом : с помощью имитационного испытания, то есть с существующими данными. Авторы опирались на большой объем данных от онкологических пациентов, которые уже прошли курс химиотерапии, проанализированной в исследовании.

В частности, группа работала с данными 840 пациентов с различными типами рака. «Мы использовали данные пациентов с раком груди, простаты, яичников и саркомой », — объясняет Эрнандо. Им удалось продемонстрировать эффективность предлагаемых ими биомаркеров резистентности против одного из трех оцениваемых типов химиотерапии — на основе соединений платины, таксанов и антрациклинов. Это исследование стало возможным благодаря поддержке Института здравоохранения Карлоса III, Министерства науки и инноваций, Cancer Research UK и Фонда «la Caixa».

Чтобы перенести эти знания в клинику, технология, разработанная исследователями CNIO, теперь должна быть проверена в условиях больницы. Группа уже получила финансирование на это от Министерства цифровой трансформации и государственной службы. Этот проект, в сотрудничестве с дочерней компанией Tailor Bio и университетской больницей 12 de Octubre (H12O), оценит интеграцию технологии в систему здравоохранения, проанализировав уже имеющиеся образцы пациентов. Это продемонстрирует, что технология готова к использованию в клинических испытаниях к 2026 году.

«Перевод биомаркера из фазы открытия в клинику редко бывает простым. Но при настойчивости и сотрудничестве можно превратить исследовательский проект в по-настоящему клинически перспективную технологию», — говорит Макинтайр.